Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IfnabL7MTU6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IfnabL7MTU6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IfnabL7MTU6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms