Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8356J3QPD3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8356J3QPD3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm8356J3QPD3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8356J3QPD3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms