Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC024978J3QPC3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BC024978J3QPC3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BC024978J3QPC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms