Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20918J3QN17 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm20918J3QN17 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20918J3QN17 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 743.3 ms