Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28051J3QMA2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm28051J3QMA2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm28051J3QMA2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm28051J3QMA2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm28051J3QMA2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm28051J3QMA2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms