Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H3BNX3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3BNX3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3BNX3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3BNX3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H3BNX3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BNX3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
H3BNX3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BNX3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BNX3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BNX3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H3BNX3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BNX3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BNX3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BNX3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BNX3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BNX3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BNX3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BNX3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BNX3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BNX3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H3BNX3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BNX3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BNX3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BNX3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H3BNX3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BNX3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BNX3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BNX3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BNX3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BNX3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BNX3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H3BNX3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BNX3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BNX3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BNX3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BNX3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BNX3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H3BNX3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BNX3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BNX3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BNX3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BNX3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H3BNX3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BNX3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BNX3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H3BNX3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BNX3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BNX3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BNX3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BNX3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BNX3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BNX3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H3BNX3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BNX3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BNX3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BNX3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BNX3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H3BNX3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BNX3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BNX3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H3BNX3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BNX3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BNX3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BNX3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BNX3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H3BNX3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BNX3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BNX3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BNX3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BNX3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H3BNX3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BNX3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BNX3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BNX3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BNX3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BNX3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
H3BNX3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BNX3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BNX3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BNX3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BNX3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BNX3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BNX3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BNX3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BNX3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H3BNX3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BNX3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BNX3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BNX3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BNX3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BNX3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BNX3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BNX3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H3BNX3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BNX3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BNX3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BNX3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BNX3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H3BNX3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms