Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KRTAP4-16G5E9R7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP4-16G5E9R7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP4-16G5E9R7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms