Protein–RNA interactions for Protein: G3XA30

Nsmce4a, MCG1618, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce4aG3XA30 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsmce4aG3XA30 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsmce4aG3XA30 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsmce4aG3XA30 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce4aG3XA30 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce4aG3XA30 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce4aG3XA30 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce4aG3XA30 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce4aG3XA30 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce4aG3XA30 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce4aG3XA30 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce4aG3XA30 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nsmce4aG3XA30 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nsmce4aG3XA30 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsmce4aG3XA30 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms