Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Pcf11G3X9Z4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pcf11G3X9Z4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
Pcf11G3X9Z4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Pcf11G3X9Z4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Pcf11G3X9Z4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms