Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Q1

Cabin1, Calcineurin binding protein 1, isoform CRA_a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabin1G3X8Q1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cabin1G3X8Q1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cabin1G3X8Q1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cabin1G3X8Q1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms