Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r167G3UW71 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r167G3UW71 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r167G3UW71 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms