Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ScaperF8VQ70 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ScaperF8VQ70 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ScaperF8VQ70 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ScaperF8VQ70 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms