Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
Ercc6F8VPZ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Ercc6F8VPZ5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Ercc6F8VPZ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
Ercc6F8VPZ5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Ercc6F8VPZ5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Ercc6F8VPZ5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Ercc6F8VPZ5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Ercc6F8VPZ5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms