Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm28048F7BCN0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28048F7BCN0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28048F7BCN0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28048F7BCN0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms