Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5218F6YH22 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5218F6YH22 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms