Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc7bE9Q9Y3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms