Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r152E9Q9N3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r152E9Q9N3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmn1r152E9Q9N3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms