Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col22a1E9Q7P1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col22a1E9Q7P1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Col22a1E9Q7P1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Col22a1E9Q7P1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Col22a1E9Q7P1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms