Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pi4kaE9Q3L2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pi4kaE9Q3L2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pi4kaE9Q3L2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pi4kaE9Q3L2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pi4kaE9Q3L2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pi4kaE9Q3L2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pi4kaE9Q3L2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pi4kaE9Q3L2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pi4kaE9Q3L2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms