Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1L0

Vmn2r80, Vomeronasal 2, receptor 80, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r80E9Q1L0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn2r80E9Q1L0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn2r80E9Q1L0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn2r80E9Q1L0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn2r80E9Q1L0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn2r80E9Q1L0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn2r80E9Q1L0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn2r80E9Q1L0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn2r80E9Q1L0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn2r80E9Q1L0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn2r80E9Q1L0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn2r80E9Q1L0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms