Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Zfp558E9Q1J0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zfp558E9Q1J0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Zfp558E9Q1J0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Zfp558E9Q1J0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Zfp558E9Q1J0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Zfp558E9Q1J0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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Zfp558E9Q1J0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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