Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm2956E9PVJ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2956E9PVJ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms