Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Syde2E9PUP1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Syde2E9PUP1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Syde2E9PUP1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Syde2E9PUP1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms