Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp6ap1lD3Z5W0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms