Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc13D3YV10 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc13D3YV10 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc13D3YV10 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc13D3YV10 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms