Protein–RNA interactions for Protein: D3YUJ3

Ccnyl1, Cyclin Y-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnyl1D3YUJ3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnyl1D3YUJ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccnyl1D3YUJ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnyl1D3YUJ3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms