Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B8ZZF3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B8ZZF3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B8ZZF3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B8ZZF3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
B8ZZF3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B8ZZF3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B8ZZF3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B8ZZF3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B8ZZF3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B8ZZF3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B8ZZF3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B8ZZF3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B8ZZF3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B8ZZF3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B8ZZF3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B8ZZF3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B8ZZF3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B8ZZF3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B8ZZF3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B8ZZF3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B8ZZF3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B8ZZF3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B8ZZF3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B8ZZF3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B8ZZF3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B8ZZF3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B8ZZF3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B8ZZF3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B8ZZF3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B8ZZF3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
B8ZZF3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
B8ZZF3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B8ZZF3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B8ZZF3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B8ZZF3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B8ZZF3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B8ZZF3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B8ZZF3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
B8ZZF3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B8ZZF3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B8ZZF3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B8ZZF3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B8ZZF3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B8ZZF3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B8ZZF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B8ZZF3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B8ZZF3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B8ZZF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B8ZZF3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B8ZZF3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B8ZZF3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B8ZZF3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B8ZZF3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B8ZZF3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B8ZZF3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B8ZZF3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B8ZZF3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B8ZZF3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B8ZZF3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
B8ZZF3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B8ZZF3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B8ZZF3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B8ZZF3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B8ZZF3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
B8ZZF3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B8ZZF3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B8ZZF3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B8ZZF3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B8ZZF3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B8ZZF3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B8ZZF3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B8ZZF3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B8ZZF3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B8ZZF3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B8ZZF3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B8ZZF3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B8ZZF3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B8ZZF3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B8ZZF3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B8ZZF3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B8ZZF3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B8ZZF3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B8ZZF3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B8ZZF3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B8ZZF3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B8ZZF3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B8ZZF3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B8ZZF3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B8ZZF3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms