Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4DGG1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4DGG1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
B4DGG1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4DGG1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4DGG1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4DGG1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
B4DGG1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4DGG1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4DGG1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4DGG1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4DGG1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4DGG1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
B4DGG1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B4DGG1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
B4DGG1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B4DGG1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4DGG1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4DGG1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
B4DGG1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4DGG1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4DGG1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4DGG1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4DGG1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4DGG1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4DGG1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4DGG1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DGG1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DGG1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DGG1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DGG1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DGG1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DGG1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DGG1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DGG1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DGG1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
B4DGG1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
B4DGG1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
B4DGG1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4DGG1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4DGG1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4DGG1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4DGG1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
B4DGG1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4DGG1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4DGG1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4DGG1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
B4DGG1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
B4DGG1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
B4DGG1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
B4DGG1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
B4DGG1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
B4DGG1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4DGG1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4DGG1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4DGG1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4DGG1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
B4DGG1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4DGG1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4DGG1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4DGG1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4DGG1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4DGG1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4DGG1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4DGG1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4DGG1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4DGG1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4DGG1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DGG1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DGG1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DGG1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DGG1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DGG1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DGG1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DGG1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
B4DGG1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
B4DGG1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
B4DGG1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
B4DGG1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
B4DGG1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
B4DGG1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
B4DGG1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
B4DGG1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DGG1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DGG1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DGG1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DGG1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DGG1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DGG1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DGG1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
B4DGG1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
B4DGG1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
B4DGG1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
B4DGG1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
B4DGG1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
B4DGG1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
B4DGG1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4DGG1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4DGG1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4DGG1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms