Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cfap58B2RW38 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfap58B2RW38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Cfap58B2RW38 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cfap58B2RW38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms