Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Brpf1B2RRD7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brpf1B2RRD7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brpf1B2RRD7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Brpf1B2RRD7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Brpf1B2RRD7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms