Protein–RNA interactions for Protein: B2KFW1

Zscan20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan20B2KFW1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zscan20B2KFW1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zscan20B2KFW1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Zscan20B2KFW1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zscan20B2KFW1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms