Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nfx1B1AY10 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nfx1B1AY10 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nfx1B1AY10 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nfx1B1AY10 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nfx1B1AY10 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.8 ms