Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOTOA8MTQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NOTOA8MTQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOTOA8MTQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOTOA8MTQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms