Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
WASHC1A8K0Z3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WASHC1A8K0Z3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WASHC1A8K0Z3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WASHC1A8K0Z3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WASHC1A8K0Z3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WASHC1A8K0Z3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WASHC1A8K0Z3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WASHC1A8K0Z3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WASHC1A8K0Z3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WASHC1A8K0Z3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WASHC1A8K0Z3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WASHC1A8K0Z3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms