Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3P2A8K0S8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
MEIS3P2A8K0S8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS3P2A8K0S8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS3P2A8K0S8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms