Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16430A6X8J1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16430A6X8J1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16430A6X8J1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm16430A6X8J1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16430A6X8J1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16430A6X8J1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm16430A6X8J1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16430A6X8J1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16430A6X8J1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm16430A6X8J1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm16430A6X8J1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm16430A6X8J1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm16430A6X8J1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm16430A6X8J1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm16430A6X8J1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm16430A6X8J1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm16430A6X8J1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms