Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJE1A6NN92 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJE1A6NN92 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJE1A6NN92 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms