Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACOD1A6NK06 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOD1A6NK06 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACOD1A6NK06 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACOD1A6NK06 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOD1A6NK06 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACOD1A6NK06 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACOD1A6NK06 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACOD1A6NK06 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOD1A6NK06 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOD1A6NK06 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACOD1A6NK06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACOD1A6NK06 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms