Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC01549A6NIU2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC01549A6NIU2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC01549A6NIU2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms