Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C5orf60A6NFR6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf60A6NFR6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms