Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRABD2BA6NFA1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRABD2BA6NFA1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRABD2BA6NFA1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABD2BA6NFA1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms