Protein–RNA interactions for Protein: A6NDS4

TBC1D3B, TBC1 domain family member 3B, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3BA6NDS4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TBC1D3BA6NDS4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TBC1D3BA6NDS4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TBC1D3BA6NDS4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms