Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA6CA6NDK9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA6CA6NDK9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6CA6NDK9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6CA6NDK9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms