Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIT2A6NDA9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIT2A6NDA9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIT2A6NDA9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIT2A6NDA9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms