Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWA8A3KMH1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VWA8A3KMH1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms