Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Plcb2A3KGF7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Plcb2A3KGF7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Plcb2A3KGF7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms