Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5640A3KG49 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5640A3KG49 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5640A3KG49 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5640A3KG49 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms