Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatsperbA2RTF1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatsperbA2RTF1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CatsperbA2RTF1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatsperbA2RTF1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatsperbA2RTF1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatsperbA2RTF1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CatsperbA2RTF1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CatsperbA2RTF1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CatsperbA2RTF1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CatsperbA2RTF1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms