Protein–RNA interactions for Protein: A2BIE1

Qser1, Glutamine and serine-rich 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qser1A2BIE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Qser1A2BIE1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Qser1A2BIE1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Qser1A2BIE1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Qser1A2BIE1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Qser1A2BIE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Qser1A2BIE1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Qser1A2BIE1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Qser1A2BIE1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Qser1A2BIE1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Qser1A2BIE1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms