Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Upf2A2AT37 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Upf2A2AT37 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Upf2A2AT37 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Upf2A2AT37 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms